Журнал был основан в 2011 году по инициативе академика РАН В.Б. Бетелина и академика РАН В.П. Платонова и изначально был ориентирован на публикацию статей о наиболее интересных результатах сотрудников Научно-исследовательского института системных исследований. Начиная с 2012 года журнал индексируется в Национальной библиографической базе данных научного цитирования РИНЦ на базе Научной электронной библиотеки eLibrary.ru. До переименования в 2025 году журнал носил название «ТРУДЫ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОГО ИНСТИТУТА СИСТЕМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК» (Труды НИИСИ РАН) и издавался с международным стандартным серийным номером ISSN 2225-7349.

В настоящее время журнал принимает и публикует статьи по широкому спектру фундаментальных, поисковых и прикладных исследований и разработок. К публикации в журнале приглашаются как отечественные, так и зарубежные ученые и специалисты, а статьи принимаются как на русском, так и на английском языке. Периодичность издания журнала – 4 выпуска в год, среднее число статей в одном выпуске –12.